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DataBase:Model Living Thing DataBase

A-B/ C/ D-E/ F-G/ H-L/ M/ N-P/ R-S/ T/ U-Z/ Japanese


The comprehensive information site for the researcher of actinomycete. The notice version, the experimenting method, a vector database, etc. There is actinomycete-related information abundantly.

The database of Arabidopsis by CSH

The site which covers all the genome information on Archaeoglobus fulgidus.

The database about markers, such as micro satellites, and SSCP in a pig, a chicken, a cow, a horse, a cat, a sheep, and a tilapia.

The database centering on gene discovery of the Xenopus laevis.

The typical site of Drosophila. In addition, it links also to project advance situations, such as cDNA and EST.

BioMedNetによるノックアウト,突然変異マウスのデータベース

NCBIが提供している,各種細菌のゲノムデータベース.GenBankやEMBL,DDBJに登録される以前のデータも網羅している

Indiana 大学によるショウジョウバエのストックなどの情報

Borrelia burgdorferiのゲノム情報をすべて網羅するサイト





C.elegansのESTデータベース

最新の論文からプロトコールまで,線虫に関するさまざまな情報を提供しているサイト

ニワトリに関するデータベース

ニワトリに関するデータベース

フランスのパスツール研究所が公開している大腸菌の総合遺伝子情報サイト

酵母ゲノムのデータベース

線虫に関するさまざまな実験プロトコールを提供
GOOD
ラン藻のProtein-Gene Linkage Mapがある

シアノバクテリアのゲノムデータベースサイト.クリッカブルマップで情報を検索することができる




GOOD
枯草菌に関する統合データベースサイト.遺伝子マップとSWISS-PROT,ENZYME,Hobacgenのデータがそれぞれクロスリンクしている

国立遺伝学研究所で保存しているショウジョウバエの系統情報など
GOOD
エール大学のCGSCが公開している,大腸菌の遺伝学情報データベース.さまざまな大腸菌株に関する情報を検索することができる
GOOD
ウィスコンシン大学のE. coli Genome Centerが公開しているサイト.大腸菌K12株のゲノム情報が網羅されている
GOOD
DDBJ登録データから,大腸菌に関するものを収集し検索可能にしたもの.“Genomic View”ではJavaを用いたグラフィカルなインターフェイスで検索できる
GOOD
大腸菌の代謝系の情報データベース.代謝系のマップを表示してくれ,知りたい経路の矢印をクリックすると関連したタンパク質の情報を得られる.利用には登録が必要であり,大学・公的研究機関に所属していれば無料

E. coli K-12の遺伝子,タンパク質のデータベース
GOOD
各種微生物別にまとめられたゲノムデータベース.分類数が膨大だが,キーワード検索・アルファベット別検索で探すことができる

MRCマウス・ラット系統情報データベース

National Research Center for Environment and Healthマウス・ラット系統情報データベース

ヨーロッパのショウジョウバエゲノムプロジェクトのサイト

生物遺伝資源委員会による実験動物のデータベース





MRCによるマウスの凍結胚・精子のサイト.ガイドラインなどもある

ショウジョウバエの遺伝学情報データベース.遺伝子マップ,トランスポゾン,関連文献などのデータベース検索を提供

ショウジョウバエ神経系のデータベース

ショウジョウバエのトランスポゾン変異,マイクロアレイ,プロテオミクス情報など

ショウジョウバエの胚発生のサイト

ショウジョウバエ脳におけるP(Gal4)lineの発現パターン

ショウジョウバエの画像データベース

多種の野生型・変異型の菌株のストックセンター
GOOD
DDBJが提供する微生物ゲノムデータベース.検索結果をグラフィカルに表示してくれる.日本語によるヘルプもある

大腸菌,マウス,ヒトなどのゲノムデータの指定領域をマップ表示してくれるサイト.情報が視覚的にわかりやすく工夫されている





Haemophilus influenzaeのゲノム情報をすべて網羅するサイト

Helicobacter pyloriのゲノム情報をすべて網羅するサイト

Jackson Laboratoryによるマウスとラットの近交系についてのサイト

Jackson Laboratoryによるマウス・ラット系統情報データベース

INE(INtegrated rice genome Explorer)のデータベース

Jackson Laboratoryによるマウスのデータベース

国内のショウジョウバエ研究者のための情報交換サイト

Streptomyes coelicolorのコスミドマップや,アルファベットで分類された遺伝標識のリストなどを公開している

かずさDNA研究所によるアラビドプシスのデータベース

総合データベース.RefSeq, OMIM, PubMed, MapView, AceView, Uni-Gene,SNPs, HomoloGene, G DB, Proteomeのデータベースにリンクしている.マウス,ラット,ショウジョウバエ,ゼブラフィッシュのデータもある





ホヤ卵に存在する母性mRNAのEST (Expressed Sequence Tags )と各クローンの発現パターンに関するデータベース

ウシ,ヒツジ,ブタのマイクロサテライト,SSCP, RFLP等のマーカーに関するデータベース

名古屋大学によるメダカのホームページ

Methanococcus jannaschii のゲノム情報をすべて網羅するサイト

NCBIが提供している各種細菌のゲノムデータベース

Jackson Laboratoryによるマウスの突然変異系統サイト

カ(蚊)の遺伝学情報サイト.ゲノムデータベース,FISHによる物理マップなどが,カの種類別にまとめられている

マウスBACクローンデータベース

繰り返し配列のマスクも行ってくれるが,graphicaloverviewがないのが難点.マウスのみ,または,齧歯類全般を,検索の対象にできる

国立遺伝学研究所哺乳動物遺伝研究室 に維持されているマウス系統に関する情報や,それらマウス系統を用いた遺伝 解析に必要な基礎情報を提供

国立遺伝学研究所による野生マウス由来系統中心のマイクロサテライト多型情報サイト

マウスのSNPsデータベース
GOOD
酵母・アラビドプシスのゲノムデータベースやヒトcDNA関連情報,その他にもタンパク質解析や遺伝子解析に関わるさまざまな情報を提供している

放線菌のデータベース.物理マップ,塩基配列,抗原・抗体のデータを検索できる

Mycoplasma genitaliumのゲノム情報をすべて網羅するサイト





NCBIによる系統分類データベース

マウスに関するデータベース

線虫の発現パターンのデータベース

ラットゲノム関連情報.ラット,マウス,ヒトのホモロジー.Radiation Hybrid(RH)など

Oak Ridge National Laboratoryマウス・ラット系統情報データベース

イネに関するデータベース
GOOD
各種微生物のゲノム情報の統合データベースサイト.ORFの情報や予測されるタンパク質の機能・構造のデータが関連づけされている

ブタとニワトリに関するデータベース

Pseudomonas aeruginosaのゲノム解析プロジェクト.塩基配列データをダウンロードできる

超好熱古細菌であるPyrococcus horikoshiiのゲノム解析データベース




GOOD
MITとMCWのデータだけからなるラットのゲノムデータベース

ラットのゲノム解析情報データベースサイト.各種データの検索が可能

Goteborg Universityによるマウス・ラット系統情報データベース

ラットの統合型データベース

ヒト・ラット・マウスの放射性ハイブリッドデータベース

酵母のゲノム解析情報データベースサイト.プロモータデータベースやC.elegansゲノムとのホモロジー検索などがある

国立大学医学部附属動物実験施設協議会情報小委員会による実験動物データベース

カイコガのESTプロジェクト

カイコガのゲノムデータベース

アラビドプシスのSNPsデータベース

アラビドプシスの目的別によるデータベースの紹介

フランスのパスツール研究所が公開している枯草菌の総合遺伝子情報サイト





アラビドプシスのデータベース.タンパク質間相互作用情報など情報が豊富.

Jackson Laboratoryによるトランスジェニック動物とターゲット変異のデータベース

ノックアウト線虫プロジェクト

線虫ゲノム配列プロジェクトによるデータベース

WWW Virtual Libraryの大腸菌関連のインデックス.データベース,文献,研究者などの情報にリンクしている

ショウジョウバエ遺伝子の発生における役割などについて解説

T31マウスの放射性ハイブリッドデータベース

ハイデルベルグ大学のRichard Herrmann's GroupによるMycoplasma pneumoniaeゲノム解析プロジェクト.塩基配列データなどのすべてのデータをダウンロードできる

オランダ王立科学芸術アカデミーによる各種微生物,プラスミド,ベクターのデータベース

Sanger Centreが提供しているSchizosaccharomyces pombeのゲノム情報サイト.塩基配列,アミノ酸配列のデータベースやそれらと関連文献を統合したPomBaseなどを公開している

TIGRによるアラビドプシスのデータベース
GOOD
ヒト,マウス,淋菌,連鎖球菌,偽巣性コウジ菌,アカパンカビ,アクチノバシラス,黄色ブドウ球菌,クリプトコッカス,フザリウムのゲノム,cDNA,EST(expressed-sequence tag)のデータベースを公開している.いずれもキーワードで検索可能

STS(sequence-tagged site)を使ったヒト,マウス,ラットのゲノムの物理地図に関するデータがある

ラット・マウスに関するさまざまなホームページの一覧.ペットとしてのラットのホームページもリストされている

アメリカツメガエルの分子マーカーデータベースほか関連情報

Archaeoglobus fulgidusのゲノム情報をすべて網羅するサイト.Nature誌(390 : 364, 1997)で発表された論文をもとに構築されている

Borrelia burgdorferiのゲノム情報をすべて網羅するサイト.Nature誌(390 : 586, 1997)に発表された論文をもとに構築されている
GOOD
TIGRの提供するDNAとタンパク質のデータベース.ヒト,イネ,マウス,ラット,アラビドプシス,ショウジョウバエ,メダカについてまとめられたデータベースがある

Haemophilus influenzaeのゲノム情報をすべて網羅するサイト.Nature誌(269 : 496, 1995)に発表された論文をもとに構築されている

Helicobacter pyloriのゲノム情報をすべて網羅するサイト.Nature誌(388 : 539, 1997)に発表された論文をもとに構築されている

Methanococcus jannaschiiのゲノム情報をすべて網羅するサイト.Science誌(273 : 1058, 1997)に発表された論文をもとに構築されている

Mycoplasma genitaliumのゲノム情報をすべて網羅するサイト.Science誌(270 : 397, 1995)に発表された論文をもとに構築されている





ブタに関するデータベース

ヒツジに関するデータベース

国立遺伝学研究所・生物遺伝資源委員会による,あらゆる生物種の遺伝資源情報データベース

線虫の代表的なサイト

アフリカツメガエルの総合データベース

ゼブラフィッシュの代表的なデータベース





農林水産省畜産草地研究所(旧 畜産試験場)が公開しているブタ,ウシ,ウマ,マウス,ヒト,ラット,ヒツジのゲノムデータベース

研究資料館に原生動物イメージデータベースがある.その他にも原生生物を研究するのに有用な情報にリンクしている

日本で維持されている自然発症疾患モデルラットの一覧

東京都立大学で保存しているショウジョウバエの系統情報や実験方法など
GOOD
日本のショウジョウバエ系統保存機関の情報.日本ショウジョウバエデータベース(JDD)がある

各生物種のデータベースがある

畜産に関する多様な情報を提供するサイト

線虫の研究者で構成される会,虫の集いの公式ホームページ

徳島大学・動物施設に設置されたラットのデータベース